ทางมหาวิทยาลัยธนบุรี มิได้นิ่งนอนใจ ได้สอบถามไปยังผู้ให้ข่าว จึงได้รับคำชี้แจงว่า ข่าวที่ปรากฏเกิดความคลาดเคลื่อนของการเสนอข่าว ข้อมูลที่ทาง สกอ. ได้ให้ข่าวไป คือ "สกอ. จะมีการติดตามตรวจสอบคุณภาพของวิทยาลัยเอกชนที่ได้รับการเปลี่ยนประเภทเป็นมหาวิทยาลัย"
ซึ่งพบว่ามีทั้งหมด 35 แห่ง เบื้องต้นทาง สกอ. จะลงไปตรวจสอบคุณภาพของวิทยาลัยเอกชนที่เปลี่ยนประเภทเป็นมหาวิทยาลัยมาแล้ว ไม่เกิน 10 ปี ซึ่งจะมีมหาวิทยาลัยในกลุ่มแรกนี้ จำนวน 16 แห่ง" ดังนั้นมหาวิทยาลัยธนบุรี จัดอยู่ในกลุ่มนี้ เนื่องจากมหาวิทยาลัยธนบุรีได้รับการเปลี่ยนประเภทจากวิทยาลัยเป็นมหาวิทยาลัย เมื่อปี พ.ศ. 2550 และประเด็นมหาวิทยาลัยเอกชนถูกร้องเรียนในเรื่องของคุณภาพมาตรฐานที่ปรากฏในข่าวนั้น เป็นการกล่าวในภาพรวมของผู้ให้ข่าว ซึ่งหมายถึง "มหาวิทยาลัยเอกชนใดถูกร้องเรียนในเรื่องขาดคุณภาพมาตรฐาน ทาง สกอ. ก็จะเข้าติดตามตรวจสอบคุณภาพด้วยเช่นกัน"
จากกรณีดังกล่าวนั้น สกอ. ได้เข้ามาตรวจเยี่ยม และตรวจสอบการปฏิบัติงานของมหาวิทยาลัยธนบุรีว่าเป็นไปตามแผนที่กำหนดไว้หรือไม่เมื่อวันที่ 27 เดือนสิงหาคม 2557 ซึ่งพบว่ามหาวิทยาลัยธนบุรีได้จัดการศึกษาเป็นไปตามแผนที่ได้ขอเปลี่ยนประเภทจากวิทยาลัยเป็นมหาวิทยาลัย ทุกประการและดำเนินการอย่างเป็นขั้นตอน รวมถึงได้คำนึงถึงคุณภาพของบัณฑิตเสมอมา ดังนั้นมหาวิทยาลัยธนบุรีจึงไม่จัดอยู่ในกลุ่มของมหาวิทยาลัยที่ถูกร้องคุณภาพสอนย่ำแย่ หรือ มหาวิทยาลัยเอกชนใดถูกร้องเรียนในเรื่องขาดคุณภาพมาตรฐาน แต่อย่างใด
ภาพการตรวจเยี่ยมจากคณะกรรมการผู้ทรงคุณวุฒิ ของ สกอ. เมื่อวันที่ 27 เดือนสิงหาคม 2557
ข่าวใดๆ ที่ออกมาช่วงนี้มักเป็นข่าวที่สถาบันการศึกษาบางแห่งใช้เพื่อกระตุ้นทางการตลาด เพื่อรับสมัครนักศึกษาใหม่ ดังนั้นก่อนตัดสินใจเชื่อข่าวใดๆ ควรอ่านให้ละเอียดก่อนตัดสินใจเชื่อข่าวนั้น